JUGADOR URUGUAYO EMILIO ZEBALLOS
A nivel internacional, debutó el 24 de enero de 2013 contra Olimpia por la clasificación a la fase de grupos de la Copa Libertadores, empataron 0 a 0 pero en el partido de vuelta perdieron 2 a 0.
En el Torneo Clausura, Emilio mantuvo la titularidad. Defensor Sporting finalizó en primer lugar del torneo, esta vez los carboneros quedaron en el segundo puesto.
Se forzó una final entre Peñarol y Defensor para determinar el campeón de Uruguay, se jugó el 4 de junio de 2013 en el Estadio Centenario, pero perdieron 3 a 1 con un hat-trick de Antonio Pacheco.
Zeballos finalizó la temporada 2012-13 con 32 partidos jugados los 90 minutos de cada uno, sobre los 33 que Defensor Sporting disputó.
La temporada 2013-14 fue más irregular para Emilio, ya que si bien cada partido que disputó los jugó completos los 90 minutos, estuvo presente en 24 de los 42 encuentros que tuvo Defensor Sporting, alternó el puesto con Pablo Pintos y Ramón Arias. Esa temporada lograron el tercer puesto en la Copa Libertadores 2014, competición en la cual anotó su primer gol internacional el 21 de marzo contra Cruzeiro en Brasil. A nivel local no convirtió goles, Defensor finalizó el Torneo Apertura en el lugar 12 y el Clausura en novena posición.
Comenzó el Torneo Apertura 2014 sin ser convocado, empataron 0 a 0 contra Nacional en la primera fecha. Ya para la fecha siguiente, jugó como titular y finalizó el Apertura jugando 10 de los 15 partidos, Defensor Sporting terminó en sexto lugar. Para el Torneo Clausura 2015, fue titular indiscutido, ya que disputó los 15 encuentros correspondientes los 90 minutos cada uno, anotó un gol el 22 de febrero de 2015 en la goleada 6 a 2 sobre Rentistas, finalizaron el cuarto lugar. En la tabla anual, quedaron el quinto puesto por lo que clasificaron a la Copa Sudamericana 2015.
Jugó su partido número 100 con Defensor el 20 de noviembre de 2015, se enfrentó a El Tanque Sisley, jugó los 90 minutos y empataron 2 a 2.
El 6 de enero de 2017, firmó contrato con Chapecoense, fue cedido préstamo por un año y comenzó la pretemporada el mismo día en Brasil. Jugó la Copa Sudamericana 2017 donde llegó a octavos de final, siendo eliminado por Flamengo.
